Mojca Hudovernik je medicino študirala na Medicinski fakulteti v Ljubljani. Leta 2004 je naredila specialistični izpit iz oftalmologije in pridobila naziv specialistka oftalmologije. Strokovno izpopolnjevanje je nadaljevala na številnih podiplomskih izobraževanjih doma in v tujini s področja okuloplastike, bolezni roženice, glavkoma in operacij sive mrene (Univerzitetna očesna klinika v Helsinkih, klinika v Schrunzu v Švici, Očesna klinika v Ljubljani). Je izkušena očesna kirurginja za operacije sive mrene in okuloplastične operacije. Redno se izpopolnjuje na evropskih in svetovnih kongresih in tako sledi novim tehnikam operacij in metodam zdravljenja očesnih bolezni. V Sloveniji je uvedla operativno zdravljenje pterigijev s transplantacijo limbalnega avtolognega prostega transplantata veznice. Je članica Slovenskega oftalmološkega združenja, Ameriškega oftalmološkega združenja (AAO) in Evropskega združenja za refraktivno kirurgijo in operacije sive mrene (ESCRS).